здравствуйте, подскажите, пожалуйста (билет на самолет)

Невозможно, у вас анулируют весь билет, если вы не воспользуетесь первым сегментом. Но попробуйте позвонить в авиакомпанию, у них есть бесплатный телефон и договориться насчет вашего сегмента

не так. Рейс самара-МСК-Каир (наверняка и обратно) стоит намного дешевле, чем отдельно купленные билеты Самара-МСК и МСК-Каир. Именно поэтому, при отказе от какого-то сегмента остальные аннулируются или пассажир хорошо штрафуется. У меня был случай. Пересадка в МСК, проспала на след сегмент. Умоляла представителей турков, чтоб не платить штраф и не аннулировались обратные. Согласились, но покупала отдельно билет до Турции. Со штрафом вышло бы дороже намного. ..Второй случай может быть применён Вами (если Вы не поездом до МСК, а самолётом поменяете) - Обратно уже летела. Билет Бангкок- МСК-Мурманск. Нужно было до МРМ позже на сутки лететь. Онлайн-звонок Агенту (заметьте-не авиакомпании, а агенту, через кого покупала) и билет мне поменяли-НЕ сдавала и покупала, а доплатила разницу на момент продажи нового билета, (уже не самого дешёвого, как был, конечно) -рублей 400, прислали новую маршрутку через час. Но факт-договориться можно.

У Вас билет Самара - Каир, а не Москва - Каир и этим всё сказано.

нет, нельзя.
его аннулируют, если одним из сегментов не воспользуетесь.
я так однажды тоже хотела но не вышло.

нет. Это вам не автобус. Вы либо летите Самара - Каир, либо никак. В самолет в Москве не посадят.
И Аэрофлот из Самары в Каир не летает! Только из Москвы. Либо у вас чартер (что маловероятно, т. к. Каир - не курорт).

А вообще вы скорее неправильно описали вашу ситуацию. Я так понимаю есть 2 билета: Самара - Москва и Москва - Каир (Аэрофлот). Это не один и тот же самолет летит. Это вы летите до Москвы, потом у вас пересадка и вылет в Каир. Если так, то вы теряете в таком случае билет до Москвы только, едете поездом заранее, чтобы встретиться с человеком, а потом ко времени вылета в Каир просто приезжаете в аэропорт и вылетаете