Будут ли проблемы со въездом в Азербайджан, если до этого посещал Армению?

Только в Украине так с ума сходят.

Вот если какие документальные сведения в сети найдут, что посещали Карабах - тогда и задержать и посадить могут, как недавно одного блоггера российского. Штампов в паспорт в Карабахе не ставят. Ну а так-то - помурыжат конечно за армянский штамп, но формально вы - турист.

Риск есть. Вопросы будут наверняка, но если без запинки и внятно объяснить этот визит в Армению (естественно, не упоминая Карабах), то пропустят.
У обладателей армянских фамилий, например, шансы отказа во въезде ниже, независимо от гражданства.

Вас не впустят на территорию Азербайджана, если вы и 10 лет назад посещали Хаестан, Арцах, иными словами Армению. Если и пропустят, то после ждите неприятностей по передвижению в Азерпайчане, а особенно перед отлетом . Я бы на вашем положение не рисковала, конечно в Азерпайчане все мериться на деньги, но Гарабах и ( армяне для них враги, как нам еврее и сионисты, да и граждане с отметкой в паспорте которые посещали израил, и те кто его подменил, сейчас их научились распознавать у нас в Иране ) поэтому и для них эта такая же больная тема .
Я как гражданка Ирана, могу посещать обе страны конфликта, у нас совсем иные договоренности, чем для РФ граждан

Друг недавно с Тбилиси в Баку на поезде ехал. С грузинской печатью в загранпаспорте легко. А вот те, кто был в Армении, с того спрашивают .Везде все проверяют, спрашивают цель визита. К кому ездили в Армению. Но тем не менее все прошли границу. Больше внимания Вам уделят, только и всего