Как купить билет на электричку в Москве? Если на РЖД их не продают?

На сайте - никак. Билет на электричку покупается в пригородной кассе или в билетном автомате, на станции непосредственно перед поездкой.

На станции или платформе...

На сайте РЖД нет билетов на электричке потому что пригородным сообщением в Московской области занимается ЦППК.

на каждой станции есть касса

П̶р̶и̶л̶о̶ж̶е̶н̶и̶е̶ ̶П̶р̶и̶г̶о̶р̶о̶д̶ ̶п̶о̶с̶т̶а̶в̶ь̶ ̶и̶ ̶у̶с̶ё̶.̶
Москва похоже до этого ещё не доросла... Расписание на том же tutu.ru можно посмотреть, продают в кассах или автоматах на вокзале.

приходишь на перон или вокзал и покупаешь по месту в кассах или в автоматах

Подойти к автомату
Купить
Profit

Покупайте прямо на станции

Если я правильно понял, ехать Вы собираетесь с Савёловского вокзала. Если это так, то Вам сильно повезло. Это единственный вокзал в Москве, который обслуживает только пригородные поезда. То есть кроме электричек там больше ничего нет. Ошибиться невозможно :) У Вас будет счастливая возможность купить билет в любом терминале самообслуживания (нажать кнопочки, выбрать маршрут Москва - Дубна, оплатить 320 рублей наличными или банковской картой) или в любой кассе с кассиршами (подойти к кассе, сказать, что Вам нужен один билет до Дубны, Вам пробьют билет и попросят его оплатить). Для покупки билета на электричку паспорт не требуется.

Кстати, ехать с Савёловского не обязательно. Можно перехватить электричку где-нибудь на Тимирязевской или Окружной (там метро есть) или, скажем, в Лианозово, это надо смотреть, как Вам удобнее, смотря откуда поедете. На этих платформах тоже ничего кроме пригородных касс нет.

P.S. Билеты на обычную электричку продаются без указания мест и без ограничения по количеству проданных билетов. Посадку можно производить в любой вагон и занимать любое свободное место. Если оно остаётся. Если не остаётся, то едут стоя :)

в метро спроси