FLAC сжимает КГц с потерями или без потерь?

смена частоты дискретизации в меньшую сторону - конечно же потеря

...теоретически - с потерями, однако, что самое интересное - плохой материал может зазвучать лучше из-за дизеринга при даунсамплинге.

Это будет двойной ресэмплинг - разумеется, с деградацией сигнала.

Не стоит рассуждать о форматах аудио.
Если всё сводится к Ютубу, то ВСЕ ролики будут ТОЛЬКО MP4, AAC, 128, 44,1.
Хоть золотые форматы аудио загружай (FLAC, WAV и прочие).
С любой частотой дискретизации.
В других сервисах можно поизголяться со звуком.
Только не на Ютубе.
Танцы с бубном с частотой дискретизации звука, ни к чему не приведут.
В рядовых звуковых устройствах бытовых ПК, никто ничего не заметит.

FLAC (англ. Free Lossless Audio Codec) — свободный кодек, предназначенный для сжатия аудиоданных без потерь.

В отличие от аудиокодеков, обеспечивающих сжатие с потерями (MP3, AAC, WMA, Ogg Vorbis, Opus), FLAC, как и любой другой lossless-кодек, не удаляет никакой информации из аудиопотока и подходит как для прослушивания музыки на высококачественной звуковоспроизводящей аппаратуре, так и для архивирования аудиоколлекции.
Сжатие данных без потерь — класс алгоритмов сжатия данных, при использовании которых закодированные данные однозначно могут быть восстановлены с точностью до бита, пикселя, вокселя и т. д. При этом оригинальные данные полностью восстанавливаются из сжатого состояния. Этот тип сжатия принципиально отличается от сжатия данных с потерями. Для каждого из типов цифровой информации, как правило, существуют свои оптимальные алгоритмы сжатия без потерь.

Материал из Википедии — свободной энциклопедии

Если сжать wav в flac и потом снова распаковать до wav - потерь не произойдет.
А вот если делать ресемплинг на не кратные (48 в 44.1) и в меньшую сторону - потери и искажения будут.