Что значит, когда начальник говорит работнику: "Ты не сможешь здесь работать с такими принципами"?

Возможно лень и нежелание понимать точку зрения начальства (читай политику предприятия)

Ну так это в каждой ситуации может что-то своё означать.
Например, бывают люди, принципиально не способные улыбаться, если у них плохое настроение. Таким людям нечего делать в отделах по работе с клиентами, потому что клиент платит деньги и выслушивать за свои деньги, что у кого-то плохое настроение, не обязан.
Есть люди, принципиально не идущие на компромисы. Таким не ужиться на работе в большом коллективе. Потому что не бывает, чтобы у всех всегда совпадали точки зрения. И чем теснее связана работа людей, тем важнее их умение договариваться друг с другом.
Есть люди, принципиально не готовые соблюдать ПДД, как и многие другие правила. Таким нечего делать на опасных производствах и работах, связанных с управлением большими, часто очень дорогими, автомобилями.

если это касается оплаты труда, то в отместку можно обратиться в налоговые органы в инспекцию по трудовым отношениям

Честность

Здесь под понятием принцип, понимается Ваше полное отношение к своим обязанностям. ,ну а начальник выразился так. Работник при приеме на работу читает полностью свои обязанности. и обещает их бесприкословно выполнять всё скрепляя своей подписью. И начинает работать. Потом позже (не понятно по каким причинам расхолаживаясь) начинается переоценка ценностей, начинаются пересмотр всего происходящего. со смыслом, а почему Я, а не Он, или Они? Но если есть конкретное разделение обязанностей между работниками, а один человек умный работящий. а другой так же там работающий Лох по жизни, и получают одинаковую зарплату, но на того первого наложено столько что Он и за второго лоха всё тянет, (называемая в народе ослизация) и всем выгодно, начальник молчит ему по боку, и все пашут, Это так же определённые принципы, действительно через которые любой работник может взбунтоваться и послать этих лохов, пусть Сами делают свою работу и сполна, или начальнику если нужен этот Лох пусть Сам за него работает. В любом случае все эти принципы должны конкретизироваться и расшифроваться перед этим работником, и начальник должен спросить работника .что бы тот всё смог конкретно обьяснить.

у нас ща, чуть повыше, в основном всё по понятиям.. . и если твои принцыпы им противоречат, значит ты лишний.
Как Хрущев когда то говорил... мнений может быть только два - одно моё и второе глупое.

Просто он хочет трахнуть этого работника. Это тонкий намёк начальника на толстые обстоятельства.)))

хочет подмять тебя и раком поставить. Не прогибайся. Лучше быть честным... и богатым