Подскажите, есть ли разница в производительности двух DDR2 на 1024 и одного модуля на 2048 ?

Есть причём очень большая

Практически нет, но одна планка по мне лучше чем две.

две (желательно одинаковые) планки будут работать параллельно т. е. с удвоенной частотой.

Разницу не заметишь, вот если поставить 2х2 то будет заметно