Если право собственности на квартиру зарегистрировано в браке, то она по-любому будет совместной собственностью. В суде по разделу имущества придётся доказывать, что часть денег была уплачена до брака. Тогда, в зависимости от того, какую сумму удастся доказать, судья уменьшит долю в квартире одного супруга, и увеличит долю другого. Всё, что уплачено в браке - пополам.
Может получиться 1\3 и 2\3, 24/67 и 43/67. Т. е. судья определит долю каждого супруга в квартире.
В суде можно предлагать разные варианты соглашений, типа "тебе машину, а ты откажись от своей доли в квартире" и т. п.
Долевая собственность предполагает совместное использование, т. е. по всем вопросам придётся договариваться.