Антон
Пуск, Выполнить, msconfig, закладка Автозагрузка
Программой Autoruns
http://www.izone.ru/sys/monitoring/autoruns.htm
Загрузите на свой компьютер программу "кклеанер"(не могу писать на анг.) , затем запустите её и зайдите в пункт "сервис"--->"Автозагрузка". И там можно посмотреть программы, которые вы хотели увидеть, а также их можно там отключить.
Установи AnVir Task Manager. Удобная программа, которая следит за автозапуском приложений, процессов.
ну ко второму ответу могу дополнить только ветку реестра HKLM/Software/microsoft/windows/run
реестр