Попыталась зайти на диск D, а он мне пишет, что диск не отформатирован и ни куда не пускает. Сама система работает нормально, всё что на C, всё в порядке. Подскажите, что делать?
Выполните команду chkdsk 
/f в командной строке. Командная строка - пуск - выполнить - cmd - ОК (WinXP) или комбинация Win+R в Win7. Операция потенциально опасна, но в вашем случае диск D уже поврежден и вы ниче не теряете. Кстати, возникновение подобных ошибок, может говорить о скором выходе диска из строя...
Разметка сбилась, это бо-бо, т. е. плохо, Иногда бывают чудеса, что оно само начинает работать, как раньше, но обычно то значит, что диск нужно форматировать (с потерей всей информации) а потом пытаться восстановить её специальными программами для восстановления данных. Обычно такие проблемы бывают со старыми или падавшими жесткими дисками.
ну еще посмотрите в свойствах этого диска какая файловая система-если RAW-придется форматировать. Попробуйте еще так-1. Запустить проводник, включить показ скрытых и системных файлов: "Сервис" - "Свойства папки" - снять галку "Скрывать защищенные системные файлы" и отметить "Показывать скрытые файлы и папки".
2. Просмотреть корневые каталоги всех разделов на жестких дисках и всех имеющихся съемных дисков (, а также папку Windows\System32 и удалить там все файлы с именем autorun и любым расширением. Важно: открывать указанные места исключительно щелчком в левой части окна проводника, в дереве каталогов, а не двойным по иконке диска, ибо в последнем случае, открывая зараженный диск, опять заражаете комп.
3. Запустить редактор реестра (Пуск - Выполнить - regedit.exe) и сделать две вещи:
а) Раскрыть ключ
HKEY_LOCAL_MACHINE/Software/Microsoft/Windows NT/Current Version/Winlogon
и проверить значение параметра Userinit. В нем должно быть C:\WINDOWS\system32\userinit.exe, и ничего более.
(Если система у вас установлена в другой раздел или папку, вместо C:\WINDOWS будет путь вашей системной папки) .
б) Удалить целиком ключ
HKEY_CURRENT_USER/Software/Microsoft/Windows/Current Version/Explorer/MountPoints2.
Последний пункт повторить для всех пользователей системы, затем перезагрузиться
⇢