Мария
В данном случае, как правило, алименты взыскиваются в твёрдой денежной сумме ! 
То что вы ИП, и то что вы алиментщик ни как не связано, будете платить, сколько решит суд и приставы!
Исходя из полученного дохода, за минусом расходов связанных с его получением и уплаченной суммы налога.
если отчитываетесь по упрощенной системе, то 25% от среднего заработка по стране. если доход минус расход то 25% от того, что осталось от дохода))).