Так как работодатель удержал у вас налог на доходы (видно по справке 2-НДФЛ) , то обязан, как агент, их перечислить в бюджет, а не присваивать себе.
Вы чисты перед налоговой.
Если инспектор настаивает - он не прав. Напишите письмо в 2-х экземплярах на имя начальника налоговой инспекции с приложением копии справки 2-НДФЛ. Сдайте в канцелярию налоговой - вам придет ответ.
Иногда достаточно лично обратится к зам. начальника налоговой инспекции с этим вопросом устно и показать справку - и вопрос будет решен. .
В такой ситуации налоговая инспекция должна идти к вашему работодателю с камеральной проверкой - а им не хочется, много работы и маленькие штрафы.
НЕ ПЛАТИТЕ.
ВАШ РАБОТОДАТЕЛЬ УЖЕ УДЕРЖАЛ НАЛОГ И ПРИСВОИЛ ЕГО СЕБЕ.