учитываются те оценки что идут в аттестат.. . по последнему году обучения. При чем в разных школах в аттестат могут идти разные предметы. И учитываем то что в каждой школе программы разные.
Например география последний раз изучается в 10 классе. в 11-м не изучается, в аттестат идет оценка за 10 класс.
Русский язык последний раз изучается в 9 классе. в 10 и 11 не изучается, но изучается литература. За сочинения по литературе ставится двойная оценка, например 4/3 - 4 за литературу, и 3 - русский язык. исходя из этого будет поставлена оценка по русскому языку, и если за 9-й класс например стоит 4 (в свидетельстве-аттестате об основном образовании) , а по итогам сочинений - 3, то в аттестате будет стоять 3.