Сотрудники банка украли деньги со счета юрлица. Что делать?

Написать заявление в полицию они и должны разбираться.

у вас есть выписка банка, по оборотам
вы можете проследить правомерность
списания средств, если же надлежащих
документов на их списание не было
(чеки, платежные поручения, предписания
суда) , то пишите письмо на имя руководства
банка с просьбой разобраться о неправомерном
списании средств без должных санкций, ну а
дальше, дальше будет видно по реакции банка