Какой еще штраф? Штрафа за просрочил паспорт не бывает. Есть штраф за проживание по месту жительства (читай регистрации) с недействительным паспортом. Ваш парень официально не имел места жительства (регистрации) , значит и не проживал по месту жительства с недействительным паспортом. Нет события правонарушения. А если тупые фимосеры захотят составить протокол, то весьма прикольно будет смотреть, что они будут там писать - какой адрес места жительства, как они обнаружили, что в этой квартире ваш парень живет с недействительным паспортом, какие у них есть доказательства.
И главное помните - статья 1.5 КоАП. Ваш парень что-то объяснять и доказывать не обязан, он не виновен пока не доказано обратное. Скажет что в тайге путешествовал или что вообще их не касается где он был после снятия с учета и все - никакого правонарушения нет.
А если будут пытаться не принимать документы или не выдавать паспорт без штрафа, то это правонарушение со стороны уполномоченных лиц по статье 5.63, штраф 3-5 тысяч.