В каком городе обращаться в трудовую инспекцию если моя работа находилась в другой области.

Обратиться можете туда, где вам удобно. Трудовая инспекция самостоятельно направит запрос в соответствующую область. Но это долго. Если хотите быстрых результатов, обращайтесь по месту нахождения организации.