Слова "что называется" выделяются запятыми? "Мальчик был, что называется, со странностями". Это вводное, нет?

Да, выделяются. Вводные потому, что без них смысл не меняется.

Лучше отвыкать от таких слов. Особенно в тексте. Смысла в них немного. И чаще одного раза они выглядят глупо. А так - запятые, да.