при оплате 50% на 50% оформлен ли сотрудник?

неизвестно.
сотрудник может быть официальным даже на одну треть ставки. или даже на четверть.

скорее всего оформлен просто зарплата черная или серая

Это зависит не от 50/50, а от того есть трудовой договор или нет, а так же не поленитесь прочитать его.

При устройстве на работу надо узнавать будут ли отчисления в пенсионный фонд

сотрудник оформлен, если с ним подписан трудовой договор и этот договор есть у вас на руках