Можно.
Но скорость работы диска через USB-порт будет значительно ниже, чем встроенного.
Правила:
1. Иметь диск восстановления системы.
2. Все критические файлы копировать еще в двух местах, например, на USB-диске и на стационарном компе.
Тогда при выходе из строя систему будет просто восстановить, заменив внутренний диск.
Почему две копии?
Не знаю. Так принято, например, у Майкрософт.
Т. е. я, после того, как на меня напал в 1991 (тысяча девятьсот девяносто первом) г. первый вирус, всегда все копирую на внешние носители. Если под рукой внешнего носителя нет, то отправляю копию на облако.
У меня ТРИ USB-диска:
1) для копий с домашнего стационарного
2) для копий с ноутбука
3) для копий с компьютера на работе.
Плюс копии на облачных дисках.
Проблема - иногда путаюсь в версиях.
Но НИКОГДА ничего не стираю.
Нет места - покупаю новый диск.
Первый внешний диск у меня был 180 КБайт (1991 г)
Последний - 3 ТБайта (2012 г) . Пока еще свободно 2 ТБайта.
Но всегда, когда заполняется предыдущий диск, покупаю на порядок более вместительный
1992 - 360 Кбайт
1993 - 10 МБайт
1996 - 700 МБайт
1998 - 3 ГБайта
2001 - 14 ГБайт
2005 - 80 ГБайт
2008 - 500 ГБайт
2010 - 1 ТБайт
2012 - 3 ТБайта