могут ли отказать в выдачи И. П.?

могут. если решат что твой бизнес не будет приносить доход, вследствие чего ты не сможешь платить налог за это предпринимательство .

Если все документы оформлены правильно и Вы дееспособны и имеете регистрацию по месту жительства - то не могут.