по состоянию здоровья не смогу заниматься физ.нагрузками ~2 недели. как сильно ослабнут мышцы за это время?

За две недели они не ослабнут, а возможно даже, если тренировки были очень частые, наоборот отдохнут и окрепнут.

Две недели нормально, не беспокойся.