Ирина, в любом случае приказ вашей организации, не должен нарушать действующее законодательство. А нижеуказанный документ разработан в соответствии со статьей 13 Федерального закона от 29 декабря 2006 г. № 255-ФЗ "Об обязательном социальном страховании на случай временной нетрудоспособности и в связи с материнством".
Должен, только в единственном случае (см. п. 50 ниженазванного порядка, но это, к счастью, не Ваш случай) , я ниже об этом пишу.
Как следует из пункта 11 РАЗДЕЛА II "Порядка выдачи листков нетрудоспособности" (далее - Порядок) , утв. приказом Министерства здравоохранения и социального развития РФ от 29 июня 2011 г. № 624н, при амбулаторном лечении заболеваний (травм) , отравлений и иных состояний, связанных с временной потерей гражданами трудоспособности, лечащий врач единолично выдает гражданам листки нетрудоспособности сроком до 15 календарных дней включительно. При сроках временной нетрудоспособности, превышающих 15 календарных дней, листок нетрудоспособности выдается и продлевается по решению врачебной комиссии, назначаемой руководителем медицинской организации. Но данное условие распространяется НА СЛУЧАИ: заболевания, профессионального заболевания, травм, в том числе полученных вследствие несчастного случая на производстве, отравлений (некоторых других последствиях воздействия внешних причин) . Данное условие распространяется лишь на случай прерывания беременности при сроке до 21 полной недели беременности . В данном случае листок нетрудоспособности выдается в соответствии с главой II Порядка на весь период нетрудоспособности, но на срок не менее трех дней (п. 50 Порядка) .
Порядок выдачи листка нетрудоспособности ПО БЕРЕМЕННОСТИ И РОДАМ смотрите в РАЗДЕЛЕ YIII вышеназванного документа.
И пусть соответствующее должностное лицо Вашей организации надлежаще разберется с этим вопросом, а не нервирует Вас. А в противном случае - пусть назовет Закон, о котором говорит "во языцех". Неужто трудно разобраться и цивилизованно относиться к работнику, тем более, находящемуся в таком "интересном положении"! Почему у обычного пользователя Инета такое желание есть, а у работодателя нет? ! Это нонсенс! Да и в женской консультации тоже хороши! 
Желаю удачи!
⇢