Могу ли я, будучи ООО на вмененке не хранить денежные средства, полученные по итогам торговли на расчетном счете предпри

Насколько я понимаю Вы являетесь учредителем этого ООО.
Все имущественные права и обязанности ООО являются собственность общества (в том числе и денежные средства в кассе/банке) , но никак не учредителя. Болезнь наших бизнесменов в том что зачастую они "путают" собственный карман с имуществом созданных ими организаций.
Есть много незаконный способов так сказать "обналичить" деньги, но не будем здесь об этом.. .
Для того чтобы получить свою долю прибыли, учредителю, по итогам квартала, полугодия, 9 месяцев, года, в зависимости от положений Устава (а зачастую бизнесмены и тут ленятся и штампуют "типовые уставы", в которых прибыль распределяется 1 раз в год) распределить полученную прибыль ООО. После распределения уже можно "забрать" часть прибыли, не забыв при этом заплатить 9% налога НДФЛ с дивидендов и отразить начисление дивидендов в отчете о движении капитала (приложение к балансу за год) , а их выплату в декларации по прибыли (раздел 3, приложение В)

ну а как же кассовая дисциплина?? ? лимит кассы? и что значит "забирать себе"? вы же 50 счет ведете?!!!

Просто так забирать себе не можете. Любую выдачу нужно документально оформлять.
Как вариант - выдавать себе зарплату, но тогда с нее нужно платить НДФЛ и взносы в фонды.

Поищите иные способы "изьятия" ден. средств, так просто это не делается, у вас ООО - юр. лицо

С банков полнимочия проверять кассу сняли, а на налоговую еще толком не возложили. У налоговой пока нет нормального регламента как проводить эти проверки, так что в конце дня делаете приходный кассовый ордер на сумму выручки за день и всю выручку выдаете себе в подотчет расходным кассовым ордером.
Раз у вас розничная торговля, то скорее всего товар вы тоже закупаете за наличку, закупаете его практически ежедневно и бегать каждый день в банк с платежками очень неудобно (даже если есть банк клиент, все равно лень) .
В конце месяца авансовый отчет на сумму закупок, а если и останется на конец месяца тыщ 500 в подотчете, то ничего страшного. Все равно какую то часть вы будете возвращать чтоб выплатить зарплату сотрудникам, ложить на счет чтоб платить налоги, электроэнергию.
Еще можно по друзьям и товарищам постоянно собирать чеки, практически не важно на что, так как ваши расходы налоговую мало волнуют, так как ваши налоги от расходов не зависят, а вам такие чеки нужны чтоб уменьшать подотчет.
Если будете вести нормальный бух. учет, то по концу года насчитаете себе дивиденды, сделаете на бумагах возврат подотчета в кассу, сразу же сделаете выдачу дивидендов (фактически вносить ничего не надо, так как вы эти деньги потратите в течении года и у вас их просто не будет) .
Еще попробуйте сделать расчет лимита по новым правилам ЦБ, которые действуют с 01.01.12 . В торговле он щас получается очень и очень приличный и сдавать деньги в банк можно намного реже чем это было раньше.

Можно оформить выдачу в под отчет расходным ордером. В учетной политике пропишите сроки возврата (столько дней, сколько нужно, но не зарывайтесь) подотчетной суммы. Затем, если не укладываетесь в сроки, внесли в кассу, взяли в под отчет.