Если ИП на ЕНВД (2работников)с 2001г не зарегистр в ФСС (работает по сей день) какие штрафы будут при обращении в ФСС???

Нет, не должны. Обязанность по регистрации в региональных отделениях ФСС РФ возникнет у индивидуального предпринимателя только в случае заключения им трудовых договоров (договоров гражданско-правового характера) с наемными работниками. Как я правильно понял все выше изложенное вам не подходит так как у вас есть два работника (но можно и слукавить раз следующие изложение дел вам не подходит) .

1. Нарушение установленного срока подачи заявления о постановке на учет в органе государственного внебюджетного фонда (ч. 1 ст. 15.3 Кодекса РФ об административных правонарушениях) Штрафные санкции
Наложение административного штрафа на должностных лиц в размере от 500 до 1000 рублей

2. Нарушение установленного срока подачи заявления о постановке на учет в органе государственного внебюджетного фонда, сопряженное с ведением деятельности без постановки на учет в органе государственного внебюджетного фонда (ч. 2 ст. 15.3 Кодекса РФ об административных правонарушениях) Штрафные санкции Наложение административного штрафа на должностных лиц в размере от 2000 до 3000 рублей

3. Нарушение установленного срока представления в орган государственного внебюджетного фонда информации об открытии или о закрытии счета в банке или иной кредитной организации (ст. 15.4 Кодекса РФ об административных правонарушениях) Штрафные санкции Наложение административного штрафа на должностных лиц в размере от 1000 до 2000 рублей

Тяжелый случай. Штрафы + взносы за все года. Сочуствую! Удачи!

Трудный случай. Штраф вроде бы 1000, а вот взносы вы обязаны были платить по травматизму. Суммы небольшие, но могут три года к оплате предъявить (в торговле -0,2 % от з/п.) , но можно попробовать зарегистрироваться, а вдруг "проскочит"? Для регистрации достаточно одного работника. Главное нужно предоставить ксерокопию трудовой книжки с записью о приеме на работу. Примите кого-нибудь временно. Срок на регистрацию точно не помню. но что-то в районе 10-14 дней с дня приема первого работника. Еще нужна выписка из госреестра, копии ИНН, ОГРН, и копия паспорта.

Как это не зарегистрировано?
Такого не бывает.... Вы могли просто не получать уведомление.