Выяснилось, что налоговая декларация во втором квартале подавалась в электронном виде через компанию которая оказывает..

Если сдана в электронном виде, ничего больше не надо . А если Вам нужно куда-то предоставить подтвержденную декларацию, можно поехать в любой день в налоговую и они поставят штамп на ней, что декларация была сдана.

а в чем собственно проблема, если декларацию подали электронно.... нужно просто распечатать протокол о принятии декларации.
В дальнейшем можете сами ходить в фнс и сдавать декларации

При сдачи отчетности по элкктронке, долджны быть подтверждающие документы от налоговой, фсс и ПФР: квитанция о приеме и извещение о вооде, может быть еще протокол.

Если это доки есть значит все нормально, подпишите деклараиции и все. Хотя конечно все должно быть подписано вовремя, не важно каим способом предоставляется.

если передавали через эдо (электронный документооборот)
то вместо печати, из программы распечатываются

1. квитанция о принятии системой эдо

2. квитанция о пересылке в налоговый орган

3. квитанция из налогового органа о вводе отчетности в базу с указанием регистрационного номера

если отчет отсутствует, то надо позвонить в консалтинговую фирму, чтобы они выслали вам сканы (отчеты и квитанции сохраняются в системе эдо, и их можно распечатать)

потом надо подписать отчет (подписывает гл. бух, если директор исполняет обязанности гл. буха, тогда подписывает директор) , поставить печать на титульный лист и подшить вместе с квитанциями в папку отчеты в хронологическом порядке