Может ли организация оплатить налог за землю за физическое лицо(договор аренды земли на физ.лице оформлен)

да если захочет

Нет. На каждого налогоплательщика в ИФНС открыт свой лицевой счет, каждому присвоен ИНН. Поступающие платежи разносятся по этим реквизитам. Уплата налогов кем-то за третьих лиц Кодексом не предусмотрена.
Статья 45. Исполнение обязанности по уплате налога или сбора
(в ред. Федерального закона от 27.07.2006 N 137-ФЗ)
1. Налогоплательщик обязан самостоятельно исполнить обязанность по уплате налога, если иное не предусмотрено законодательством о налогах и сборах.
(а уж это иное в этом Вашем случае не проходит))) )

Погодите, Вы арендатор? Неясно из вопроса. Если арендатор, то вот Вам точный ответ из налогового кодекса:
Статья 388. Налогоплательщики
1. Налогоплательщиками налога (далее в настоящей главе - налогоплательщики) признаются организации и физические лица, обладающие земельными участками на праве собственности, праве постоянного (бессрочного) пользования или праве пожизненного наследуемого владения.
2. Не признаются налогоплательщиками организации и физические лица в отношении земельных участков, находящихся у них на праве безвозмездного срочного пользования или переданных им по договору аренды.

Земельный налог платят лишь СОБСТВЕННИКИ, а не арендаторы.

Вы (физ. лицо) должны платить арендные платежи, а налог на землю платят собственники!
При чем тут налог на землю, если этот участок в аренде?

Нет, не может. Физ. лицо считатеся плательщиком налога на землю. В случае, если организация заплатит налог, тогда физ. лицо будет иметь материальную выгоду и должно будет оплатить налог на доход физ. лиц с полученной прибыли ( а прибыль - это сумма налога на землю) Удачи!