Если схема АПН составлялась гаишником без моего присутствия , как можно ее исключить из материалов дела?

Выдержка из Административного регламента ДПС (Приказ МВД № 185-2009):
В случае несогласия участников дорожно-транспортного происшествия со схемой, отказа от ее подписания либо отсутствия при ее составлении содержание схемы места совершения административного правонарушения удостоверяется понятыми.
Если схема составлена в Ваше отсутствие, но при понятых и ими подписана, то она не может быть исключена из материалов дела.

Во первых действующее законодательство по АПН не содержит такого понятия как схема.
соответсвенно это просто рисунок неизвестного мировой курьтуре художника.
Во вторых Эти схема не была приложена к протоколу самим ИДПСом, как того требует ст. 28.2.2, а подкинуты туда неизвестным доллицом ГИБДД. ее существование в материалах дела не предусмотрено действующим законодательством об административных правонарушениях

Подайте ходатайство об исключении схемы АПН из числа доказательств, как полученную с нарушением закона. В Регламенте МВД есть форма схемы, так там кроме обязательной вашей подписи еще и подписи 2-х свидетелей требуются!! !
Доказательство, полученное с нарушением закона не может быть принято судом в качестве доказательства вашей вины!

Исключить из материалов дела нельзя, так как это доказательство и находится в материалах дела. Как Вы себе представляете ее исключить? Оторвать и выбросить?

Эту схему можно считать, если она подписана гаишником, можно считать его свидетельскими показаниями.

Вы можете лишь ходатайствовать об исключении ее из доказательств, но скорее всего это ход-во останется без удовлетворения. Так как доказательства, в соответствии со ст. 26.11 КоАП РФ оцениваются в совокупности.

Само по себе составление схемы без Вас не является основанием для исключения схемы из материалов дела, т. к. нормами КоАП РФ этот вопрос не регламентирован.
Вот если Вы аргументированно докажете несостоятельность этой схемы, например, представив фотографии, ее опровергающие, то можно попробовать.
Но в конечном счете зависит от настроения судьи.