Может ли бухгалтер самовольно перечислять зарплату на карту другого банка, если я согласия не давала?

Я так понимаю, что - нет. Вы должны были самостоятельно открыть счет в банке и предоставить заявление с реквизитами, куда следует перечислять. Вот вы и написали заявление, касающееся СБ. Вам же, наверное, важно, чтобы банкомат в удобном месте был?
Основание из ст. 136 ТК РФ "Заработная плата выплачивается работнику, как правило, в месте выполнения им работы либо перечисляется на указанный работником счет в банке на условиях, определенных коллективным договором или трудовым договором. "
.

потребуйте от бухгалтера перечисления туда, куда желаете.

Без заполнения документов Банка открыть счета в рамках зарплатного проекта не получится.
Иначе с таким же успехом я на месте бухгалтера могу пречислить на свой счет зарплату сотрудников :)
Зарплата белая и пушистая - Вам обязаны ее выплатить: либо через кассу, либо на карту банка, оформленую на Вас.
Если Вы подписали договор на карту "другого банка" (в рамках генерального договора зарплатного проекта) - то поздно. Можно только *просить* (не *требовать*) выплатить з/п "через кассу" / по кассовой книге, бухгалтер Вам в праве отказать, ссылаясь на ген. договор зарплатного проекта и подписанное Вами соглашение.

С каким банком заключон договор у владельца (хозяина) предприятия туда он и будет их переводить.

Разные ситуации бывают. Даже если Вас заставили подписать какие то бумаги касательно зарплатного проекта с банком - Вы всегда можете отказаться. Например у нас сотрудница пришла и написала заявление - что на счет в новом банке отказывается получать зарплату, по причине того, что в этом банке у неё имеется непогашенный кредит на крупную сумму и все деньги на зарплату у неё бы списывали безакцептно в счет погашения долга по кредиту. Директор пошел ей навстречу и разрешил переводить на указанный ею счет в Сбербанке. Потому что работник был ценный для предприятия. А если работник так себе - могут и не войти в положение, а например попросить написать заявление по собственному и возьмут другого на его место, такого который более лоялен к решениям руководства, в трудовую инспекцию всякие там доносы не строчит, права не качает и прочие подобные демарши не устраивает. Все так делают. Незаменимых людей нет, а работу найти непросто.

P/S Предприятие руководствуется к тому же не Вашим удобством в получении денег, а как менее затратно выдать Вам зарплату, что дешевле. Например в Сбербанке условно за обналичку и выдачу по расходному ордеру - 1% комиссия, по переводу денег на зарплатную карту - 0,5% - вот и идут где дешевле - 0,2%, а то и вовсе без комиссии. За год внушительная экономия, я Вас уверяю.