можно ли обжаловать гражданско-правовой договор?

Можно, если будут для этого основания. Если докажете поддельность подписи покойного на договоре, да и даже если она подлинная- то тоже можно в некоторых случаях.
Часто работодатели прикрывают фактические трудовые отношения гражданско-правовыми договорами. Потому что если имеет место договор гражданско-правового характера, то исполнитель выполняет работы за СВОЙ РИСК. То есть, заказчик НЕ ОБЯЗАН знакомить его с правилами ТБ и т. д.
Но если фактически имели место трудовые отношения, то работодатель обязан был выполнить все требования закона относительно ТБ.
И в случае гибели работника работодатель не только попадает на деньги, но и ответственные лица могут быть привлечены к уголовной ответственности. Вопрос о характере взаимоотношений сторон ( гражданские или трудовые) может быть решен судом. При этом, все доказательств будут расссматриваться в их совокупности. Если суд установит, что фактически имели место трудовые правоотношения-то и применит соответствующее законодательство, невзирая на договор.

Не можно, а нужно. Я сейчас "бодаюсь" со своим бывшим шефом по поводу подделки моей подписи в документах, а если учесть, что у него в прокуратуре работает дочь и зять - как мне сложно. Я начал с того, что мне недоплатили, в результате руководство, что бы скрыть подделало мою подпись в двух договорах, а прелесть ситуации в том, что оба документа датированы ...воскресеньем!!!

На мой взгляд не нужно обжаловать договор, а необходимо органам проводящим проверку по факту смерти работника предоставить доказательства если таковые имеются о подделке договора, подписи в договоре просить о назначении почерковедческой экспертизы по свободным образцам подписи умершего, с данными правоотношениями тесно не сталкивался но техника безопасности при проведении работ безусловна должна соблюдаться работодателем.

Статья 143 УК РФ. Нарушение правил охраны труда

1. Нарушение правил техники безопасности или иных правил охраны труда, совершенное лицом, на котором лежали обязанности по соблюдению этих правил, если это повлекло по неосторожности причинение тяжкого вреда здоровью человека, -
наказывается штрафом в размере до двухсот тысяч рублей или в размере заработной платы или иного дохода осужденного за период до восемнадцати месяцев, либо обязательными работами на срок до четырехсот восьмидесяти часов, либо исправительными работами на срок до двух лет, либо принудительными работами на срок до одного года, либо лишением свободы на тот же срок.
2. То же деяние, повлекшее по неосторожности смерть человека, -
наказывается принудительными работами на срок до четырех лет с лишением права занимать определенные должности или заниматься определенной деятельностью на срок до трех лет или без такового либо лишением свободы на срок до четырех лет с лишением права занимать определенные должности или заниматься определенной деятельностью на срок до трех лет или без такового.

Работодатель обязан обеспечить соблюдение техники безопасности, журналы там у него какие-то должны быть, чтобы работник за технику безопасности расписался, что его инструктировали об этом, я не силен в законодательстве о труде, точные ссылки дать не могу

Кроме того в соответствии со Статьей 168 ГК РФ:
Сделка, не соответствующая требованиям закона или иных правовых актов, ничтожна, если закон не устанавливает, что такая сделка оспорима, или не предусматривает иных последствий нарушения.
А так же Статья 166 ГК РФ:
1. Сделка недействительна по основаниям, установленным настоящим Кодексом, в силу признания ее таковой судом (оспоримая сделка) либо независимо от такого признания (ничтожная сделка) .

То есть признание судом сделки недействительной не обязательно, достаточно того, что сделка не соответствует закону.