Вопрос по винчестеру

если на системном диске полно места, то скорее всего на скорость работы ни как не повлияет

Можно конечно, но желательно разбить на разделы. На скорость конечно повлияет, но не существенно, запущенные приложения как правило загружаются в оперативку и если её хватает беспокоится не о чем.

... естественно будет притормаживать

фиолетово какой будете использовать - с ресурсом ничего не случится в течении продолжительного времени, а вот про общую производительность (расположение основного файла подкачки ОС на том диске, куда операционку поставили, надо думать он логический C:) абсолюто правильно думаете, рекомендую все-таки второй использовать, а если сильно за сам диск переживаете - используйте внешний (есть кстати хорошие темы на 500-1500 ГБ с т. з. цены от Maxtor)

Можно любой, кроме системного

это зависит от самого винта. у меня на терабайтнике WD10EADS стоит windows 7 и он же используется для раздачи торентов (около 100). Никакого дискомфорта не чувствую.

Здравствуйте! У меня стоит система из 3ех винтов. 1 под систему, и 2 под мультимедиа. Не заметил принципиальной разницы в скорости работы приложений и системы в целом, с какого харда бы не раздавалось (исп. uTorrent). Единственное что, на каком жестком диске не велась бы раздача, порежется скорость интернета.
Раздавайте с того, который Вам удобнее.
Особенно если у вас ХДД подключены по SATA.

лучше второй а то виндовс слетит