Жесткий разделен на два раздела. Системный, и файловый. Когда захожу в файловый раздел (D), компьютер немного думает

а на системном разделе диска сколько свободной памяти?
для работы windows на жестком диске нужно хотя бы 3гб свободного места.
пробуйте чистить рестр он тоже на скорость работы влияет

сними всякие архивации и индексации с сжатиями

запусти проверку х. д. с исправлением ошибок. возможно битые секторы. вот он и думает, а что, блин, с ними делать?

Как уже писалось в одном посту - 2 и более раздела на одном жестком диске существенно замедляют его работу. поэтому так делать крайне не рекомендуют. То же самое и с индексированием, и с сжатием. Это нормально, даже если раздел пустой. Так же зависит от конфигурации системного блока и возраста жесткого диска.

Попробуйте отформатировать диск D, а программы и игры лучше ставить на диск С.

Под нынешнюю Windows 7 нужно выделить как минимум 40-50Gb.
Под Windows XP для надёжности - около 30-40. Опять же как минимум, так как HDD будет постоянно забиваться.
Заходит долго из-за лишнего хлама на системном диске. А если это не так:
1) Скачайте CCleaner
2) Почистите куки и реестр.
3) Скачайте Defraggler
4) Проведите дефрагментацию всего HDD.

выключи индексирование, сделай дефрагментацию

если дефрагментация не поможет ...то скорее всего проблема в софте .. вирусы, трояны, черви.... винду переустанавить может быть ...у меня тоже иногда думает часики когда открывает жёсткий диск.... после проверки программой чистке реестра работает чуточку быстрее.. . но ничего не помогает лучше чем выключить комп дать остыть часик... .
а ещё идея в голову пришла ...что сам хард может быть подпорчен.. . это же жёсткий диск вращение медленее к примеру или головка слабо реагирует ...процессор устаёт при обработке считывании инфы с раздела

в забитости диска С, возможно.