что лучше:административная ответственность со штрафом и обвинительным актом или

Речь полагаю все-таки идет о наказании в виде штрафа по обвинительному приговору или же прекращение дела за примирением сторон. Естественно лучше прекращение дела т. к. не будет судимости и всех негативных последствий с ней связанных. Лучше было бы конечно прекратить на стадии следствия, чтобы потом не тратить свое время и нервы на поход в суд. Но с учетом того, что по сложившейся практике, при доказанности вины человека, органы предварительного следствия дела по этому основанию (ст. 76 УК РФ, ст. 25 УПК РФ) не прекращают т. к. , как тут верно заметили статистика для них дело важное. В суде же проблем с прекращением, как правило, не бывает. Главное чтобы были выполнены все необходимые условия: 1) преступление небольшой или средней тяжести (ч. 1 ст. 158 УК РФ - небольшой, так что подходит)
2) лицо на момент совершения кражи должно быть юридически не судимо (ранее не привлекалось или же все прошлые судимости сняты или погашены) .
3) полное заглаживание вреда потерпевшему.

обвинительного акта при административной ответственности не бывает.
прекратит скорее всего сукд, т. к. органы следствия не ахотят портить себе статистику, но вам без разницы.
Если прекращение гарантировано, я бы выбрала прекращение дела в суде.
Только какая связь между административкой и 158? Здесь не вам решать, все дело в сумме ущерба.

В суде.