Что делать если опознала подозреваемого в краже, а через 2 суток после ареста у него вдруг появилось алиби.

Зафиксировать факт отсутствия (до минуты) и факт появления (тоже до минуты) этого самого алиби, спросить в суде за оба случая

Значит, он подсуетился и организовал алиби.. .
.. теперь доказывай что оно- ЛИПОВОЕ

заявление в прокуратуру

лично вам ничего делать не надо.. .
все сделает сторона обвинения (следователь, дознаватель) , защиты (адвокат)

у него хорошие адвокаты! или блат с мвд!

А как это может быть? Подумайте сами? - кража, это тайное хищение, ты его (вора) видеть не могла, в противном случае это уже грабеж.... или что-то я не понимаю....

Темур, обязательным условием кражи является осознание виновного, что он тайно совершает хищение, не смотря даже на то, что за ним наблюдают; но если вмешиваются очевидцы в происходящее и вор при этом продолжает преступные действия, то кража перерастает в грабеж.
Юлия, признать непричастность данного человека в краже с учетом того, что Вы опознали его, следователь не может. Видать, Вы что-то не договариваете и скорее плохо запомнили человека, которого видели, на что и ссылается следователь. А алиби действительно может быть липовое и его надо проверять, также, если Вы хорошо владеете ситуацией по ходу расследования, то надо писать ходатайства о проведении следственных действий, которые, по Вашему мнению, смогут подтвердить причастность данного человека, совет пригласить в качестве своего представителя адвоката.