Почему яблоки в шарлотке "уплыли" наверх?

Предположу, что яблок было несколько больше, чем обычно и они были более сочными, тогда они дали много сока и этот сок сделал тесто более жидким. Возможно, если Вы укладывали яблоки довольно плотно, они при нагревании стали увеличиваться в размере и немного поднялись в толщу теста (Вы, наверное, видели, что происходит с яблоками, которые пекутся в духовке, они поначалу немного вздуваются, как бы закипают под кожицей, а потом оседают) . Если я предполагаю правильно, то тесто, ставшее более жидким могло и не пропечься.

Возможно я не права, но вспомните, сколько раз вы открывали духовку чтоб проверить готовность? возможно в этот раз чаще чем обычно.... такая реакция у шарлотки (бисквита) бывает на частое открывание духовки.... Это чисто мое предположение...)

Может яблок мало.

Выпекается шарлотка в течение 30 - 40 минут при 180 градусах в заранее хорошо разогретой духовке. Здесь и кроется первая частая ошибка. Обязательно разогревай духовку как минимум за 15 минут до того, как поместишь в нее шарлотку! В недостаточно разогретой духовке шарлотка пригорит сверху, но так и не пропечется внутри. Второе важное замечание – никогда не открывай духовку при выпекании! От любого сквозняка бисквит осядет и превратится в клейкую, сухую и малосъедобную субстанцию.

Тесто получилось чуть гуще, так бывает из-за муки

Однажды прочла совет и так делаю. Делаю тесто жидкостью, как на сметану, кладу яблоки порезанные и всё перемешиваю в чашке, выкладываю на противень. В шарлотке главная хитрость - яблок должно быть не мало и не много.

А вы как яблоки укладываете: прямо в тесто или заливаете тестом яблоки?
Если в тесто укладываете, то просто тесто слишком густое.
Я заливаю яблоки тестом, ничего не всплывает.

тесто жидковато, а вы как уклыдываете яблоки, я слой теста, яблоки, слой теста, яблоки, потом опять слой теста