Можно ли выписать из свидетельства о рождение отца? (Если он не родной) если да то как?

Есть еще один вариант. Если родители в разводе, то можете сами подать иск в суд о замене графы в св-ве о рождении отца на имя другого человека. Основанием является, что фактически воспитанием занимался тот второй кого вы хотите вписать. Это, как правило, отчим или родной дед.

Только на основании судебного решения.

Только на основании судебного решения. Иск об оспаривание отцовства на основании ст. 52 СК РФ.
Статья 52. Оспаривание отцовства (материнства)

1. Запись родителей в книге записей рождений, произведенная в соответствии с пунктами 1 и 2 статьи 51 настоящего Кодекса, может быть оспорена только в судебном порядке по требованию лица, записанного в качестве отца или матери ребенка, либо лица, фактически являющегося отцом или матерью ребенка, а также самого ребенка по достижении им совершеннолетия, опекуна (попечителя) ребенка, опекуна родителя, признанного судом недееспособным.
2. Требование лица, записанного отцом ребенка на основании пункта 2 статьи 51 настоящего Кодекса, об оспаривании отцовства не может быть удовлетворено, если в момент записи этому лицу было известно, что оно фактически не является отцом ребенка.
3. Супруг, давший в порядке, установленном законом, согласие в письменной форме на применение метода искусственного оплодотворения или на имплантацию эмбриона, не вправе при оспаривании отцовства ссылаться на эти обстоятельства.
Супруги, давшие согласие на имплантацию эмбриона другой женщине, а также суррогатная мать (часть вторая пункта 4 статьи 51 настоящего Кодекса) не вправе при оспаривании материнства и отцовства после совершения записи родителей в книге записей рождений ссылаться на эти обстоятельства.

Вам нельзя. Это может сделать только отец. Если он подаст в суд на оспаривание отцовства, сделает экспертизу ДНК и она будет отрицательная, то суд отменит запись об отцовстве. Если отец против - никто его заставить не может.