ЕНВД и торговля посадочным материалом, как облагать S земельного участка?

На каждый принадлежащий вам объект недвижимости, в том числе земельный участок, полагаю имеется техпаспорт (инвентаризационный, правоустанавливающий документ) , где должно быть указано на предназначение того или иного участка (торговый он или складской) .
В соответствии с пунктом 3 статьи 346.29 налогового Кодекса налогоплательщики, осуществляющие розничную торговлю через объекты стационарной торговой сети, имеющие торговые залы, при исчислении налоговой базы по единому налогу на вмененный доход используют физический показатель базовой доходности "площадь торгового зала".
Статьей 346.27 Кодекса установлено, что площадь торгового зала определяется на основании инвентаризационных и правоустанавливающих документов, к которым, в частности, относятся технические паспорта на нежилые помещения, поэтажные планы, схемы, экспликации, договоры аренды (субаренды) нежилых помещений или их частей и другие подобные документы.
Исходя из этого и расчитывайте налоговую базу.
И почитайте еще ПИСЬМО ФНС РФ от 12.05.2008 N 02-7-10/170
"ОБ ОКРУГЛЕНИИ ЗНАЧЕНИЙ КОЛИЧЕСТВЕННЫХ ПОКАЗАТЕЛЕЙ НАЛОГОВОЙ ДЕКЛАРАЦИИ ПО ЕДИНОМУ НАЛОГУ НА ВМЕНЕННЫЙ ДОХОД"

Не согласна с Екатериной.
Действительно продажа выращиванных саженцев и посадочного материала на земельных участках прилегаемых к месту реализации подлежит налогообложению ЕНВД. В данном случае объектом налогообложения признается не площать земельного участка используемого для совершения сделок розничной купли-продажи, а торговое место. Если вы используете один участок, следовательно налоговая база расчитывается исходя из базовой доходности одного торгового места.