продажа квартиры больше милиона но 2 собственика нужно ли будет платить налог

если квартира в собственности более 3-х лет, то налог не платится

Насколько я знаю, налог платится с объекта недвижимости, следовательно - да, нужно, просто этот налог будет разделён на две части соответственно доле собственности каждого.

Да, надо будет.
Вычет в 1 млн. руб предоставляется на квартиру а не каждому продавцу.
Продали за 2 млн. каждому по 1 млн досталось так вот с 500 тыс. будь любезен заплати налог.
Но это при условии что квартира в собственности менее трех лет

Продавец жилья полностью освобождается от уплаты налога, если он является собственником этого жилья не менее 3-х лет. Не имеет значения, каким образом Вы стали владельцем квартиры - купили, приватизировали, получили по наследству, - срок, после которого Вы будете освобождены от уплаты налога, составляет три года с того момента, как Вы стали собственником. Чтобы получить налоговую льготу, нужно написать заявление в налоговую инспекцию по месту регистрации, иначе вас могут вынудить заплатить как сам налог, так штраф и пени, если Вы не сделаете этого вовремя (до 1 мая следующего года после регистрации сделки) .
Если продавец является собственником квартиры менее трех лет, он обязан заплатить подоходный налог в размере 13% с суммы, превышающей 1 миллион рублей, полученной в результате продажи квартиры. В Вашем случае этот налог будет делиться на две части соразмерно доле каждого собтвенника. Даже если Вы прожили в квартире по договору социального найма несколько десятков лет, а затем приватизировали ее, но с момента приватизации прошло менее 3-х лет, то при продаже недвижимости Вы будете обязаны заплатить подоходный налог. Если квартира досталась вам по наследству или по договору дарения, и Вы решили ее продать до истечения 3-х летнего срока, Вы также будете должны заплатить подоходный налог.