В чем фишка придумать закон о 13% если недвижимость менее 3-х лет собственности более миллиона?Все равно продают за 990т

Первое - налоговая не на себя деньги "сдирает", это государственный орган и государству он нужен не для того, чтобы "последние копейки из людей выжимать". Нет налогов - нет бюджета - нет расходов. Люди в маленьких городах, получающие зарплаты именно из бюджета, очень хорошо эту связь понимают.
Второе - эта "фишка" придумана для того, чтобы особо умные идивидуумы не занимались перепродажей квартир, не оформляя юридический статус предпринимателя. Согласитесь, при таких ограничениях особо много квартирами не поторгуешь: можно, конечно. показать, что пять квартир в год ты реализовал по 200 тыс. руб каждую, но рано или поздно такие сделки кого надо точно заинтересуют - легализовать свои доходы (реальные) , постоянно занижая цену сделки, не слишком получится.
Далее: вычет в один миллион рублей применяют, как правило те, кто не может доказать, за какую цену он квартиру реально купил. Иначе использовал бы вычет в размере цены покупки, не запрещено.
Такие случае, конечно, бывают, но опять же нечасто, верно? Приватизация - все знаем, поучаствовать можно один раз. Наследство - тоже не особенно часто повторяется. Дар. Ну или продавец Вам тоже очень умный попался и в свое время уговорил в договоре 990 тыс. руб. стоимость показать. Он-то налога избежал. а покупателю - каково? Продолжать обманывать дальше.
Вот и получается "фишка" с обязательным обложением дохода от продажи недвижимости, бывшей в собственности непродолжительное время, "придумана" для ограничения незаконного предпринимательства в виде перепродажи квартир, в том числе и полученных не совсем законным путем. При этом у законопослушных граждан могут возникнуть некоторые сложности, но каждый жизнь в обществе оплачивает некоторой стесненностью собственной свободы.

в ДКП лучше указывать реальную стоимость....

Во-первых, почему за 990? Не облагаемая налогом сумма - ровно 1 миллион рублей. Во-вторых, уже давно "все " так не делают. Большинство сделок проходят в "белую".
Ну, а кто сие придумал неизвестно. Конечно это бред, но никуда от этого бреда не деться. А еще совсем недавно этот срок равнялся пяти годам.

поясню налоговый вычет для покупателя недвижимости 260.000рублей при покупке за два миллиона и выше.... если чел. покупает по ипотеке реальную надо указывать ...и покупать по заниженной и отдавать в конверте дурочья то- же мало

Фишка в следующем, если вы квартиру рыночной стоимостью 10 млн. руб. купите по договору купли - продажи за 990 тыс. руб. , а потом вдруг по какой - то причине в судебном порядке договор купли - продажи будет признан недействительным, то покупатель должен будет вернуть продавцу квартиру, а продавец, в свою очередь, 990 тыс. руб. вместо полученных им 10 млн. руб. Во - вторых, значительно уменьшается налоговый вычет, который мог бы получить покупатель квартиры.