Чем отличается определение доли в "натуре" от определения порядка пользования квартирой ?

Определение доли в натуре -это установление права собственности на выделенную часть имущества в натуре.
Определение порядка пользования это договоренность сторон о порядке пользования данным (общим) имуществом, без изменения существующих долей в праве общей долевой собственности.

При определении доли в натуре происходит реальное выделение доли и собственность перестает быть долевой. То есть, вы становитесь единоличным собственником отдельного, обособленного объекта недвижимости, а не доли в нем. Вы можете продавать, сдавать в найм, в аренду, вселять иных граждан и т. д. без согласия ( уведомления) сосбственников -как это происходит в случае, если собственность общая.
При определении порядка пользования такого не происходит. Вам в пользование просто выделяется отдельная комната, определяется порядок пользования местами общего пользования, а долевая собственность как была долевой, так и остается.

В "натуре" это когда у жилого помещения есть отдельный вход, раздельные коммуникации, санузлы и т. д. Каждому собственнику выделяется отдельное помещение. Это сродни дому, разделённому пополам.
Определение порядка пользования жилым помещением подразумевает, что каждому из сособственников выделятся для пользования своя комната. Разумеется, всё это происходит по судебному решению.

Пользование определенной комнатой можно оформить соглашением либо через суд.

Определение порядка пользование - это когда "смотрящий", (судья) , выносит решение - ваши "нары" (то бишь комната) нижние.
В натуре, это когда вы имеете на руках Свидетельсво о регистрации права и Договор передачи в собственность (комнаты)

В натуре - это когда комната выделена в отдельное право- с изменением техдокументации бти и присвоением отдельного почтового адреса- кв 5 комната 1- и получено регсвидетельство на самостоятельный обьект недвижимости - комнату.

Определен порядок пользвания- вид собственности остается долевой, обьект недвижимости- квартира, у Вас доля- 1\3, а в судебном решении определено- кто какой комнатой пользуется- Иванов комнатой 12 м2, петров- комнатами 14 м2 и 10 м 2.