имеется муниципальное жилье имеется долг за квартиру около 70 000 имеют ли право отказать мне в прописке брата!?

А согласие, разрешение муниципалитета есть? Ведь он дает такое право в данном случае, и дело даже не в долгах.
Жилищный кодекс РФ Глава 8 Статья 70

Статья 70. Право нанимателя на вселение в занимаемое им жилое помещение по договору социального найма других граждан в качестве членов своей семьи
1. Наниматель с согласия в письменной форме членов своей семьи, в том числе временно отсутствующих членов своей семьи, вправе вселить в занимаемое им жилое помещение по договору социального найма своего супруга, своих детей и родителей или с согласия в письменной форме членов своей семьи, в том числе временно отсутствующих членов своей семьи, и наймодателя - других граждан в качестве проживающих совместно с ним членов своей семьи. Наймодатель может запретить вселение граждан в качестве проживающих совместно с нанимателем членов его семьи в случае, если после их вселения общая площадь соответствующего жилого помещения на одного члена семьи составит менее учетной нормы. На вселение к родителям их несовершеннолетних детей не требуется согласие остальных членов семьи нанимателя и согласие наймодателя.

2. Вселение в жилое помещение граждан в качестве членов семьи нанимателя влечет за собой изменение соответствующего договора социального найма жилого помещения в части необходимости указания в данном договоре нового члена семьи нанимателя.

Имеют, так как в России прописки нет.

Запросто. Муниципалитету жилье принадлежит, он и условия диктует.

муниципалитет не разрешит вселить в квартиру вашего брата - он не включен в договор социального найма

Ох, не надо прописывать брата - он будет иметь равные права с вами во всем, включая приватизацию. - для буквоедов - теперь это называется регистрацией по месту жительства (постоянная прописка) , по месту проживания (временная прописка)

Могут отказать, но не по причине имеющейся задолженности, а скажем по недостаточному количеству кв. метров в квартире.