Кто оплачивает справку из БТИ? Кто должен платить в ФРС за регистрацию?

Договаривайтесь. Все по договоренности.
Только вот продавец сильно оптимистичен.
Думаю вы у него единственный и очень долгожданный покупатель. :))
Пригрозите отказаться от сделки. Вариантов жилья - море. Это покупателей нет.

обычно все расходы пополам оплачиваются

Как договоритесь. Но поскольку ипотека нужна только покупателю, то и расход, мне кажется, его.

Это ВЫ так думаете, а продавец думает иначе. И логика его рассуждений понятна. Насчет справки БТИ он прав, таковая не нужна при обычной продаже, продавец может разделить с вами эти расходы, но вправе этого и не делать, что касается госпошлины, то здесь однозначно платите вы, поскольку регистрации подлежит не договор купли-продажи, а регистрация перехода права собственности к вам.

кому нужна сделка тот и платит

Антон, Ваш продавец абсолютно прав. Платит тот, кто заказывает музыку вообще-то.
Вашему продавцу для продажи совершенно не нужны никакие дополнительные справки типа Выписки из ЕГРП<справки из БТИ и так далее. Эти все справки-требования именно Вашего банка, так как вы-ипотечник.
Поэтому платите.
Теперь по поводу госпошлины за регистрацию права в ФРС.
До 1 марта 2013 года существовало две госпошлины.
1.За регистрацию договора купли-продажи.. Договор подписывали две строны, поэтому именно эту госпошлину продавец и покупатель уплачивали пополам.
2.За регистрацию права собственности. Эту пошлину уплачивал покупатель (право-то на него регистрировалось)
С 1 марта госпошлина за регистрацию договора отменена, осталась только госпошлина за регистрацию права. И уплачивать ее-обязанность только покупателя. так что эти 2000 руб-только ваши. И квиток только на Ваше имя.
И не надо особо наседать на продавца в смысле, что вы-единственный и неповторимый покупатель. Ситуация на рынке недвижимости действительно сейчас очень хреновая, спроса практически нет. Но раз вы согласились на эту квартиру<почему бы завтра не появиться обычному покупателю с наличкой, которому совершенно не требуются всякие лишние справки.
Так что-не выпендривайтесь и платите.

справку из БТИ можете оплачивать как угодно, по договоренности... вообще-то, кому она нужнее, тот и платит.
Что касается оплаты госпошлины за РЕГИСТРАЦИЮ ПРАВА СОБСТВЕННОСТИ. Я не зря выделил данную фразу. Госпошлина является федеральным налогом, обязанность уплачивать которые предусмотрена Конституцией РФ. За регистрацию перехода права собственности госпошлина не уплачивается. Соответственно, ни о каких "расходы пополам" в отношении госпошлины речь не может идти.. по крайней мере, документально. В платежном документе должна быть именно фамилия покупателя.

Покупатели квартиры, которую как доверенное лицо продавала я, тоже брали ипотеку. Я предоставляла им ВЕСЬ необходимый пакет документов, в том числе и "вон ту синенькую бумажечку из БТИ, которая вообще-то необязательна, но - банк для ипотеки требует".
За регистрацию - платили покупатели.
Напомните продавцу, что сейчас квартиры (особенно - на вторичном рынке) продаются ОЧЕНЬ плохо, и, сэкономив пару тысяч на БТИ, он потеряет несколько миллионов, упустив Вас (покупателя). Удачи!

Вопрос, кто должен платить, остаётся на усмотрение сторон. Как договоритесь.

через терминал