Можно ли выделить часть дома в натуре, если у соседей через стенку есть незаконная пристройка?

Договор пользования конкретными комнатами заключите .сразу. И если при доме есть не зарегистрированный участок, надо быстрей регистрировать. А то, соседи могут зарегестрировать увеличение площади и будут претендовать на бОльший " кусок земли".

При выделении доли в натуре будет учитываться только узаконненое жилье и техническая возможность

Это грозит постоянными коммунальными склоками в квартире, а особенно если поменяются соседи. Если сейчас нормальные люди, то завтра может быть семья с тяжелобольным человеком и Вы будете вынуждены ходить вдоль стеночки и на цыпочках ибо у тёти Клавы болит голова от вашего ботанья и чтобы после 21-00 посмотреть телевизор то это надо делать в наушниках ибо тётя Маша не может заснуть ...Или заедет какой-нибудь алкаш, который до 4 утра будет праздновать день граненного стакана и Вы замучаетесь вызывать ментов к нему да и те, узнав что сосед всего лишь поёт за стенкой не очень то будут стремиться к Вам. А сосед будет опускаться и оставлять закуску недоеденную на своём столе, разводя тараканов, постоянно пытаться посолить или поперчить Ваш суп и не стирать носки месяц, отвечая на Ваши замечания что, мол, носки мои и стираю когда хочу и здесь не поможет ни один участковый ...Обычные склоки обычной коммунальной квартиры ...А оно Вам надо? Не живётся без запаха браги или валидола в квартире или оставления света в туалете на сутки с сегодняшними ценами на электричество ?!