Получение налогового вычета с продажи квартиры.

Давайте разберемся не спеша. Если квартира в долях с женой, то декларацию подавать и налоги платить будет каждый за себя.
При заполнении декларации каждый из вас имеет право применить налоговый вычет 1 млн. Налог у каждого из вас составит (2750 /2 - 1000) х 13% = 48,75 т. р. Лично Вам его придется заплатить, т. к. Вы работаете неофициально и налогов не платите.
А вот у жены может быть взаимозачет, если она в той же декларации заявит возврат на недополученную сумму (примерно 40 т. р) за покупку этой квартиры. Тогда ей придется заплатить всего (48,75 - 40) = 8,75 т. р. Это возможно только в том случае, если в год продажи квартиры она работала и перечисленные с ее зарплаты налоги составили не менее 40 т. р.
Но если она в декрете (как Вы указали), значит налогов не перечисляла, а следовательно, и возвращать ей будет нечего. Тогда придется и ей заплатить 48,75 т. р. налога с продажи своей доли квартиры.
Она сможет получить оставшуюся сумму возврата (прим. 40 т. р.) только после выхода из декрета.
Еще учтите такой нюанс: если квартира у застройщика покупалась без отделки, то суммы, затраченные на ремонт новостройки (напр. 800 т. р.) можно включить в стоимость квартиры. Тогда первоначальная стоимость продаваемой квартиры будет (1720 + 800) = 2520 т. р. В этом случае при подаче декларации вам нужно применять вычет, равный стоимости продаваемой квартиры, т. е. 2520 т. р. Тогда налог составит (2750/2 - 2520/2) х 13% = 14,95 т. р. на каждого из супругов.

Вы путаете: налоговый вычет делается ПРИ ПОКУПКЕ квартиры.

За миллион 720 тыс. р .вернули налог с белой зарплаты? на двоих? за 2750 тыс. р. продаете? в долях продаете отдельными договорами? тогда минус льготный миллион у каждого - с 375 тыс. р .каждый заплатит налог 13 %..

Возврат налогового вычета при покупке квартиры и применение налогового вычета с целью уменьшения суммы дохода при продаже на 1 000 000 это не единое целое, это разные налоговые вычиты
1. Для получения налогового вычета при приобретении квартиры необходимо подать декларацию по форме 3-НДФЛ начиная с года заключения договора (не единую декларацию за все года, а конкретно по годам 2016,2017 и …). Налоговый вычет на 2-х в общей сложности составит 223 600 (возврата денежных средств Вам) так как сумма исчисляется с 1 720 000
2. В случае продажи доходом будет являться 2 750 000 – 1720 000 = 1 030 000 по ставке 13 % и равен 133 900, сумма 1 030 000 может быть уменьшена путем применения налогового вычета на 1 000 000, тогда облагаемая сумма налога составит 30 000, а сумма налога 3 900
Осуществляется ли взаимозачет сразу же не могу сказать, лучше уточнить в ИФНС, или воспользуйтесь программой заполнения декларации за соответствующие годы на сайте ИФНС, она сама все рассчитает.