Почему несмотря на огромные достижения СССР в развитии науки и техники, труд рабочих крестьян оставался ручным?

В сельском хозяйстве и сейчас доля ручного труда высока.
Попробуйте, к примеру, научить робота отличать побег культурного растения от сорняка.

Тогда на первом месте было качество. И без рекламы. Сравните жилые дома "ручной работы" 50-60х годов и современные гробницы.

Ручным он стал после 1991 года, когда производство покинули специалисты, способные обслуживать сложное оборудование, в том числе, с числовым программным управлением.

Вопрос поставлен некорректно. О каком именно периоде истории идет речь? Уровень механизации в народном хозяйстве СССР весьма неравномерно развивался - есть минимум 5 периодов развития/деградации, завязанных на войны, изменения в плановом хозяйстве и методах хозяйствования.

Достижения были или на бумаге, или требовали развития смежных отраслей, что не возможно, прорывы были не везде.

ого. На что замахнулись.
Для начала разберемся с некоторыми мифами, спрятанными в вопросе. Говоря о огромном таки развитии науки и техники в СССР стоит правильно оценить слово огромный. С точки зрения мирового развития вклад не чем особо не примечательный, по ряду отраслей лидерству, по ряду паритет, по ряду же все очень ужасно. Но с точки зрения истории самого СССР это действительно огромнейшее развитие - по сравнение с Российской империей - в которой в принципе развитие науки и техники было зачаточно и ограниченно (ниже будет сказано почему). По сути это был переход от аграрного государства к индустриальному в кратчайшие сроки, увы но болезненный и однобокий - сил и средств банально на все не хватало.
Теперь к сути вопроса.
Начнем из далека, из Древней Греции и Рима. Как вам должно быть известно - это были рабовладельческие государства, в своей основе ориентирование на аграрный сектор и строительство. Также стоит учесть добычу полезных ископаемых - но она до промышленного уровня явно не дотягивала. Для всех этих сфер использование рабского труда более чем оправдано: минимальные издержки, низкое требование к квалификации рабочих рук, простота обучения по сути примитивным способом труда. Это было просто выгодно - толпа бесправных людей, которых нужно кормить и следить чтоб не разбежались.
Теперь посмотримна ту часть истории, где аграрная структура государства сталкивается синдустриальной. Ярчайший пример США в середине ХІХ в. Рабовладельческий юг и свободолюбивый север (там правда тоже все очень интересно - советую почитать). Оказалось, что для работы на заводе умения копать/таскать и проч. работу выполнять недостаточно - нужна квалификация. И тут вылез недостаток рабовладельчества - раб ну совсем не заинтересован в качестве своего труда - его и так накормят. Поэтому север выступил за отмену рабства (точнее не совсем - но это не суть нашего вопроса), а аграрный юг (помним по древним империям идеальную форму устройства для аграрного государства?) за сохранение.
Т. о. рабовладельчество эффективно в сельском хохяйстве, но совсем не нужно в пром. производстве.
И тут как не вспомнить что до 1868 г. Российская империя была ни чем иным как рабовладельческим государством (98% населения -крепостные в аграрном секторе)
Закончим ликбез. Перейдем ответу на поставленный вопрос. Увы, но за вас я его давать не буду, просто посоветую узнать в каких условиях жило сельское население СССР, когда им дали паспорта в руки, как они могли переехать в другое место/город. И все станет предельно ясно.
NB: и еще момент - по своему развитию с/х в СССР было более экстенсивно, хотя и велись разработки новых сортов и культур и на сегодня те работы дали очень много новых сортов, но борьба с генетикой, как лженаукой привелак тому, что просто было потеряно время. И да - при экстенсивном развитии высокая квалификация рабсилы нужно - ее просто нужно больше.

Сколько тракторов было во время СССР и сколько сейчас?
Как работали заводы со станками современными и как сейчас?

а в Китае этого сейчас не видно вам

Тракторов было столько, что все еще из них собирают гибриды, а мощных тракторов сейчас и нет. Чтобы заново вспахать заросшие поля в Пермском крае, приглашали трактора с персоналом из Удмуртии, раньше же такая техника в своих колхозах была. Мы, горожане, удивлялись, когда крестьяне покупали в магазине целые противни бисквита и по 3-4 3-хлитроввх банки сока - просто попить. Они говорят: "Тогда мы жили при коммунизме"

Если бы все делали машины, то у людей бы небыло работы. А без работы где брать средства на существование. "От каждого по возможности - Каждому по потребности".