Из ООО в ИП. Право ли начальство?

Нет, от Вас не вправе требовать заявления по собственному желанию! "Переделать" ООО в ИП невозможно. В Вашем случае, скорей всего, произошла ликвидация ООО.
Статья 180. Гарантии и компенсации работникам при ликвидации
организации, сокращении численности или штата работников организации.

При проведении мероприятий по сокращению численности или штата работников организации работодатель обязан предложить работнику другую имеющуюся работу (вакантную должность) в соответствии с частью третьей статьи 81 настоящего Кодекса.
О предстоящем увольнении в связи с ликвидацией организации, сокращением численности или штата работников организации работники предупреждаются работодателем персонально и под роспись не менее чем за два месяца до увольнения.
Работодатель с письменного согласия работника имеет право расторгнуть с ним трудовой договор до истечения срока, указанного в части второй настоящей статьи, выплатив ему дополнительную компенсацию в размере среднего заработка работника, исчисленного пропорционально времени, оставшемуся до истечения срока предупреждения об увольнении.

Статья 178. Выходные пособия

При расторжении трудового договора в связи с ликвидацией организации (пункт 1 части первой статьи 81 настоящего Кодекса) либо сокращением численности или штата работников организации (пункт 2 части первой статьи 81 настоящего Кодекса) увольняемому работнику выплачивается выходное пособие в размере среднего месячного заработка, а также за ним сохраняется средний месячный заработок на период трудоустройства, но не свыше двух месяцев со дня увольнения (с зачетом выходного пособия) .
В исключительных случаях средний месячный заработок сохраняется за уволенным работником в течение третьего месяца со дня увольнения по решению органа службы занятости населения при условии, если в двухнедельный срок после увольнения работник обратился в этот орган и не был им трудоустроен.

что то не так, почему бы не сделать перевод работников к другому работодателю?

Ну как сказать.. . Радуйтесь что вас вообще берут. Могли бы вообще закрыть, выгнать вас и набрать других. А зачем вам непрерывный трудовой стаж? В нем никакой пользы сейчас нет! Единственное придется заново на отпуск зарабатывать.. . Но все по договоренности решается.. . Конечно лучше оформлять 'по соглашению между работодателями', но не все на это пойдут. У нас увольняли и принимали (меня - за месяц до декрета) . И ничего страшного.