Возник вопрос о гарантированном минимуме оплаты труда работников

Региональный МРОТ определяется исходя из социально-экономических условий и величины прожиточного минимума трудоспособного населения в соответствующем субъекте РФ (ч. 3 ст. 133.1 ТК РФ) и не может быть ниже МРОТ, установленного федеральным законом (ч. 4 ст. 133.1 ТК РФ) .
Если в вашем регионе установлен свой МРОТ и ваша фирма вовремя не представила в уполномоченный орган исполнительной власти мотивированный письменный отказ от соответствующего соглашения о МРОТ (ч. 8 ст. 133.1 ТК РФ) , то оно распространяется и на вашу организацию.
Все равно этот МРОТ будет установлен задним числом с 1 января 2010 года ( это сейчас во многих регионах так) , потом придется пересчитывать.
Почитайте статью 133.1ТК РФ, если ваш работодатель не захочет присоединиться к этому соглашению, он должен заявить об этом в течение 30 дней, если не заявит, то должен платить не ниже регионального МРОТ . Если заявит, то будут вызывать его, представителей вашего профсоюза, представителей работников, так что не так все просто.

Почему бы не пойти на компромисс. Например -Принять мнение работодателя, но увеличить базовую часть премиальных. Или наоборот, принять Ваше мнение но уменьшить базовую часть премиальных. Все равно к чему то надо приходить.

придется договариваться путем переговоров, т. к. ни у кого из сторон нет преимуществ в этом споре или "убийственных" для другой стороны аргументов.

Переговоры и еще раз переговоры. А насчет соглашения узнайте поподробнее, если они не заключили нового то они скорей всего продлили старый, так как администрация области наврят ли допустила бы это... .