Доплаты за выслугу лет и за высокое профессиональное мастерство являются обязательными?

Этот вопрос решает само предприятие.
Могут устанавливать и платить, а могут не устанавливать и не платить.
Увы, здесь - воля работодателя.

Нет. Надбавки такого рода устанавливаются работодателем по его усмотрению.

Заработная плата работнику устанавливается трудовым договором в соответствии с действующими у данного работодателя системами оплаты труда.
Системы оплаты труда, включая размеры тарифных ставок, окладов (должностных окладов) , доплат и надбавок компенсационного характера, в том числе за работу в условиях, отклоняющихся от нормальных, системы доплат и надбавок стимулирующего характера и системы премирования в соответствии с ч. 2 и 4 ст. 135 ТК РФ устанавливаются коллективными договорами, соглашениями, локальными нормативными актами (принимаемыми работодателем с учетом мнения представительного органа) в соответствии с трудовым законодательством и иными нормативными правовыми актами, содержащими нормы трудового права.
Основным локальным нормативным актом, в котором определяется система оплаты труда в организации, традиционно является Положение об оплате труда в организации (у работодателя) , в котором определяются формы оплаты труда, основные элементы оплаты труда (размеры окладов (ставок) , доплат и надбавок) , порядок начисления и выплаты заработной платы и другие вопросы.
Как видите, ТК РФ не устанавливает в обязательном порядке выплаты за выслугу лет, доплаты за высокое профессиональное мастерство. Эти вопросы надо смотреть в коллективном договоре и других локальных актах.

а чего в трудовом договоре написано?

Доплаты за стаж и мастерство - есть доплаты определяемые локальными актами предприятия (Колдоговором, положением по оплате труда) если они установлены данными акатми то обязательны до тех пор пока не упразднеены.
На законодательном уровне нет обязаннности устанавливать и платить их.

Всё зависит от коллективного договора.

Нормы, позволяющие работодателю устанавливать надбавки и доплаты, содержатся в статье 135 ТК РФ.

В соответствии с частью 5 статьи 135 ТК РФ работодатель, с учетом мнения представительного органа принимает локальные нормативные акты ( Это может быть коллективный договор) , устанавливающие системы оплаты труда. На основании части 2 статьи 135 ТК РФ системы оплаты труда включают в себя доплаты и надбавки компенсационного и стимулирующего характера.
К стимулирующим надбавкам и доплатам относятся выплаты: за высокое профессиональное мастерство, за классность, за ученую степень, за высокие достижения в труде, за выполнение особо важной работы и так далее.
Устанавливая надбавки и доплаты, работодатель может самостоятельно определить основания для их выплаты, а может воспользоваться «Перечнем доплат и надбавок к тарифным ставкам и должностным окладам работников объединений, предприятий и организаций производственных отраслей народного хозяйства, на которые начисляются премии» , утвержденным Постановлением Госкомтруда СССР и Секретариата ВЦСПС от 18 ноября 1986 года №491/26-175. Этот документ является действующим по настоящее время, поскольку не противоречит законодательству Российской Федерации.
На основании данного перечня в организации могут быть установлены следующие виды надбавок и доплат:
* за высокое профессиональное мастерство;
* классность;
* высокие достижения в труде;
* выполнение особо важной работы на срок ее проведения;
* ученую степень (а также на оклад, установленный с учетом ученой степени) ;

Ряд надбавок и доплат, предусмотренных законодательством, является обязательным. К их числу относятся, например, надбавка за классность, за выслугу лет и стаж непрерывной работы

Так что: обязательное - выслуга лет
на усмотрении организации, предприятия - высокое профессиональное мастерство.

это выплаты стимулирующего характера при переходе на новую систему труда примерно апрель 2009 года были рекомендованные документы где прописывалось какие выплаты к чему относятся если очень надо могу посмотреть

Насколько я помню, то нет. Как правило, подобные выплаты устанавливаются Коллективным договором. Хотя, конечно, я могу и ошибаться.