На организацию подали в суд, о невыплате з/п, но данный работник у нас не числится, , что можно сделать?

к отзыву на иск прилагаете справку, что в интересующий период он в списочном составе организации не состоял, трудовые отношения не оформлялись и знать его не знаете

просто так, со словами: "я тут в ооо "ромашка" работал, а мне денег не заплатили", в суд ни как не обратишься, слушать ни кто не будет.
если гражданин обратился в суд, значит он предъявил какие-то дкументальные доказательства возникновения трудовых отношений.
начнется судебное разбирательство, узнаете на каком основании он зарплату требует, тогда и будете думать, что с этим делать.

Если он предоставит свидетельства, что у вас работал. Например свидетелей, или даже он сможет доказать, что делал у вас то и работал в том то помещении и есть у вас то то.... То скорее всего речь идет о том, что человек у вас работал, но был полностью нарушен ТК. И в суде тоже не дураки, вы это учтите! В принципе если он работал, до доказать не так трудно!

А за какой период? может раньше работал?

Выплачивать зарплату вовремя.

Сходите на суд и предъявите эти данные, что он у Вас не числится.

Эти странные вопросы являются правдой или вашими хотелками? Нет документов, значит вы нарушили положения ТК об обязательном оформлении трудового договора и прочих документов. Я это так вижу, и с высокой вероятнностью то же самое увидит и судья.