Почему слово "андрогин" мужского рода, хотя обозначает как раз обоеполость?

Патамушта, што это слово -- иностранное.. .
--
Драсти )))))))))

И то же самоe со словом гермафродит.. .
А почему слово окно среднего рода, а дверь - женского, стол - мужского, а кровать - женского?
Мужской род и мужской пол не всегда связаны напрямую. Слово мужественность - женского рода, а мужество - среднего.
Слово врач - мужского рода, а относиться оно может и к женщине и к мужчине.

Категория рода у имен существительных является классифицирующей или несловоизменительной (каждое существительное относится к определенному грамматическому роду) и строится как противопоставление трех родов — мужского, женского и среднего. Существительные мужского рода семантически определяются как слова, способные обозначать существо мужского пола, существительные женского рода — как слова, способные обозначать существо женского пола, а существительные среднего рода — как слова, не способные указывать на пол. При этом у одушевленных существительных мужского и женского рода (названий людей и частично — названий животных) связь с обозначением пола — непосредственная (ср. отец и мать, учитель и учительница, лев и львица) , а у неодушевленных существительных (частично — также у названий животных) — опосредованная, проявляющаяся как возможность стилистического переосмысления в образе существа соответствующего пола (ср. рябина и дуб в народной песне «Тонкая рябина» , а также Дед Мороз, Царевна-лягушка и т. п.) . Родовые различия существительных выражены только в единственном числе, поэтому существительные pluralia tantum не принадлежат ни к одному из трех родов. Особое место занимают так называемые существительные общего рода, способные обозначать лицо как мужского, так и женского пола и соответственно обладать грамматическими признаками мужского и женского рода (сирота, недотрога, плакса) .

Род существительных выражается как морфологически — системой флексий существительного в единственном числе, так и синтаксически — родовой формой согласуемого или координируемого слова (прилагательного или другого слова, склоняющегося как прилагательное, глагола-сказуемого) . Поскольку система флексий единственного числа не у всех словоизменительных типов существительных однозначно указывает на определенный род (так, существительные II склонения могут относиться и к женскому, и к мужскому роду: м. р. слуга, ж. р. прислуга) , последовательно однозначным является синтаксическое выражение рода существительных. У так называемых несклоняемых существительных этот способ выражения рода является единственным (ср. р. недавнее интервью, м. р. длиннохвостый кенгуру и т. п.) .

Способностью указывать на пол обладают также формы согласуемых и координируемых слов в сочетании с существительными общего рода (круглый (м. р. ) сирота и круглая (ж. р. ) сирота) , а также с существительными мужского рода — названиями лиц по профессии, должности (врач, инженер, директор) , которые могут при указании на женский пол лица сочетаться (только в форме именительного падежа) с формами женского рода координируемых и (реже) согласуемых слов: Врач пришла, У нас новая врач (разговорно) .

нулевое окончание с твёрдой основой

Потому что андрогин - это человек, обладающий признаками обоих полов (или вовсе бесполый) . А человек - мужского рода. ))))

Хе-хе! Вот позор мне за незнание мифологии!