Почему слово НЕТ схожее во многих языках (древние и современные европейские, русский) а слово Да - везде разное?

Это слово многозначное. В каких-то значениях совпадает, в каких-то нет.

да
нареч. , союз, да́бы, да́же; др. -русск. да, ст. -слав. да ἵνα, καὶ, ἐάν, ἀλλά, δέ (Супр.) , болг. да "и; но; чтобы", сербохорв. да̏ "чтобы, да", словен. dȃ "чтобы", др. -чеш. da "поистине, конечно", польск. da "с тем, чтобы" и т. д.
Обычно относят к и. -е указ. местоимению do- наряду с *di- в др. -прусск. din вин. ед. ч. "его", вин. мн. díns, авест. , др. -перс. вин. ед. dim "его, ее", вин. ед. ср. р. dit "то". Сравнивают с греч. δή, ἐπειδή "итак, после того, как", ἤδη "уже", лат. dēnique "с этих пор, затем", dōnec "до тех пор, пока"; см. Бернекер 1, 176; Бругман, Grdr. 2, 2, 391; Буазак 180 и сл. ; Младенов 119; Траутман, Apr. Sprd. 321; однако da в знач. "(с тем) чтобы" напоминает русск. пусть, дава́й и толкуется из и. -е. *dō "дай, пусти"; см. В. Шульце у Френкеля, IF 43, 304 и сл. См. дать.
Так что в славянских и греческом совпадают в значении "давай, пусть, конечно"
Сколько синонимов, столько и соответствий в других языках, а у нашей частицы ДА синонимов очень много: верно, согласен, пусть будет, давай, пускай, ладно, хорошо, конечно и т. д. Это говорит о богатстве оттенков этого слова в русском языке по сравнению с другими.

Сам удивляюсь!

Потому что люди чаще говорят "нет", чем "да"

Лингвистика как раз изучает подобные вопросы. Разные слова имеют разную скорость расхождения. Их классифицируют и по этому признаку судят о близости языков и времени их разделения. Например, слова, обозначающие членов семьи изменяются очень медленно, орудия труда ---быстро...

Видимо от купцов такая унификация. Не сразу ясно, что они купцы. Пока объяснят, что им нужно, десяток обвинений и ненужных предложений выслушают. От них же, подозреваю, и схожесть произношения "один", "два", "три". Есть еще схожесть слова "мама". Тут купцов трудно "обвинить". Наверно из Африки это слово пришло десятки тысяч лет назад