Стоит ли мне продолжать учить английский, если я уже 3 недели не могу понять present simple(на 100%),вы бы продолжали?

Если нужен английский, то продолжай учить дальше. Во всех языках очень много правил и исключений из них (порой исключений даже больше) , и во многих случаях нельзя трактовать вещи однозначно, как следствие, во многих языковых институтах до сих пор ведутся дискуссии о правильности того или иного написания. Так что мой совет-продолжай учить дальше, что понимаешь-хорошо, не понимаешь-просто выучи.

Для начала выучи родной язык! В русском present simple абсолютно такой же

я тоже ниче не понимала пока училась в училище по традиционному методу. попробуйте этот я выучила всю грамматику за полгода и заговорила работая
за рубежом. по этому методу учебники использовала 53 формулы и оптимизи
рованный универсальный http://www.dragunkin-books.ru/

Язык понимать не надо - это не теория вероятности. Язык надо зубрить, пилить как на музыкальном инструменте долго и постоянно.

1. В случае проблем с теорией полезно перейти на другой учебник. Возможно, там материал будет изложен более доступно, с понятными примерами. Лучше использовать самоучитель. Он предназначен именно для самостоятельного изучения, и каждая тема там сопровождается тренировочными упражнениями, к которым есть ключи для самопроверки. Когда все упражнения будете выполнять безошибочно - значит, тема усвоена хорошо.
2. На начальном этапе изучения иностранного языка ни в коем случае не следует выхватывать отдельные грамматические темы, а надо изучать грамматику строго по принципу от простого к сложному, постепенно расширяя свои знания и обязательно закрепляя их с помощью упражнений. Например, тот же Present Simple включает в себя несколько тем, которые в самоучителе даются не все сразу, а постепенно: 1) повествовательные/вопросительные/отрицательные предложения с глаголом to be 2) то же с прочими глаголами 3) то же с модальными глаголами 4) общий вопрос и специальные вопросы.. . 5) альтернативный вопрос.. . ну и т. д.
Естественно, переходить к новой теме надо только хорошо усвоив предыдущую. Впрочем, это общий принцип для изучения любого учебного предмета.

Что вообще значит понимаю на 80%? 3 недели - не срок. Учи и не ной. Я вот, когда на тайский бокс пришел - больше чем 3 недели не мог научиться ногой в голову бить. Намного дольше. И что? И ничего - научился.

А я и сейчас Present simple на 100% не понимаю, хотя считаю что по-английски говорю свободно.

Грамматика не главное. Вот дети разговаривают на родном языке и грамматики не знают. Пытайтесь слушать адаптированные аудиокниги для первого уровня или элементарные диалоги из аудиокурсов. Будете просто чувствовать, как оно правильно. Попробуйте также учить английский на сайте http://lingualeo.ru/r/8bi687. Там и грамматику довольно просто объясняют.